Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT35Q92764 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT35Q92764 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms