Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF12Q8WXF0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRSF12Q8WXF0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms