Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCA10Q8WWZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCA10Q8WWZ4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCA10Q8WWZ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCA10Q8WWZ4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms