Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C15orf40Q8WUR7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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C15orf40Q8WUR7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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C15orf40Q8WUR7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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C15orf40Q8WUR7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C15orf40Q8WUR7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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C15orf40Q8WUR7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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