Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMIEQ8NEW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIEQ8NEW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms