Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CSNK2A3Q8NEV1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSNK2A3Q8NEV1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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