Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APPL2Q8NEU8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APPL2Q8NEU8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APPL2Q8NEU8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms