Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF548Q8NEK5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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