Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDG6

TDRD9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD9Q8NDG6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
TDRD9Q8NDG6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TDRD9Q8NDG6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TDRD9Q8NDG6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms