Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA1Q8N8W4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PNPLA1Q8N8W4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 333.3 ms