Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBL4BQ8N7F7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UBL4BQ8N7F7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms