Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PHTF2Q8N3S3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHTF2Q8N3S3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHTF2Q8N3S3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms