Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLIP4Q8N3C7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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CLIP4Q8N3C7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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