Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCML4Q8N228 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCML4Q8N228 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms