Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
H1FOOQ8IZA3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H1FOOQ8IZA3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms