Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
RAB11FIP4Q86YS3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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RAB11FIP4Q86YS3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB11FIP4Q86YS3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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