Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPBP1Q86WP2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GPBP1Q86WP2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms