Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG9AQ7Z3C6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG9AQ7Z3C6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1075.9 ms