Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC29A4Q7RTT9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC29A4Q7RTT9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms