Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP49Q70CQ1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP49Q70CQ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP49Q70CQ1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP49Q70CQ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP49Q70CQ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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