Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIAA1549LQ6ZVL6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIAA1549LQ6ZVL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1549LQ6ZVL6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms