Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MAMDC4Q6UXC1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MAMDC4Q6UXC1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms