Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VSTM1Q6UX27 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms