Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LCLAT1Q6UWP7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LCLAT1Q6UWP7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LCLAT1Q6UWP7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms