Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SUSD1Q6UWL2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms