Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SARM1Q6SZW1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SARM1Q6SZW1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms