Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC137Q6PK04 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC137Q6PK04 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms