Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDF2Q6PJF5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDF2Q6PJF5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms