Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CASC4Q6P4E1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CASC4Q6P4E1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms