Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NANOGP8Q6NSW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NANOGP8Q6NSW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms