Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A4Q6AI14 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A4Q6AI14 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms