Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALS2CLQ60I27 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALS2CLQ60I27 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms