Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RNF123Q5XPI4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RNF123Q5XPI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms