Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHIC1Q5VXU3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHIC1Q5VXU3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CHIC1Q5VXU3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms