Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB2Q5VUJ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
EFCAB2Q5VUJ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
EFCAB2Q5VUJ9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms