Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RNF20Q5VTR2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF20Q5VTR2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms