Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SAMD5Q5TGI4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD5Q5TGI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms