Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3BQ5T9A4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATAD3BQ5T9A4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATAD3BQ5T9A4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms