Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYCP2LQ5T4T6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYCP2LQ5T4T6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms