Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZFYVE27Q5T4F4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms