Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC3LQ5T215 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC3LQ5T215 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC3LQ5T215 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms