Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HIVEP3Q5T1R4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HIVEP3Q5T1R4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms