Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HP1BP3Q5SSJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HP1BP3Q5SSJ5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms