Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A13Q5J8X5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A13Q5J8X5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A13Q5J8X5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms