Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HERC4Q5GLZ8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HERC4Q5GLZ8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HERC4Q5GLZ8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms