Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRDTQ58F21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRDTQ58F21 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms