Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDK2Q58EX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SDK2Q58EX2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms