Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ACTBL2Q562R1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms