Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C4orf17Q53FE4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C4orf17Q53FE4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms