Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBK1Q52WX2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SBK1Q52WX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms